Nuevo estudio de TAU rastrea patrones de propagación de coronavirus en Israel

Un equipo de investigadores de la Universidad de Tel Aviv dirigido por la Dra. Adi Stern de la Facultad de Biología y Biotecnología Celular Molecular de la Facultad de Ciencias de la Vida George S. Wise ha llevado a cabo la primera secuenciación genómica a gran escala de la nueva cepa de coronavirus que ha infectado hasta la fecha a más de 16,500 personas en Israel.

Los científicos aprovecharon su mapa genómico para identificar mutaciones que indican de dónde se originó el virus y luego se diseminaron dentro de Israel. El estudio se basa en un análisis de las secuencias genómicas de más de 200 pacientes en hospitales de todo Israel, que en conjunto constituyen una muestra representativa de la población general.

Los estudiantes de doctorado de TAU Daniel Miller, Noam Harel, Talia Kostin, Omer Tirosh y Moran Meir realizaron la investigación para el estudio en colaboración con científicos de la Universidad Emory, el Instituto Gertner, el Centro Médico Chaim Sheba, el Instituto Holon de Tecnología, el Hospital Assuta Ashdod, Hadassah Ein Karem Medical Center, Soroka Medical Center, Barzilai Medical Center, Poriya Medical Center y Genome Center en el Technion Institute of Technology.

Los orígenes del coronavirus.
“El nuevo coronavirus se caracteriza por mutaciones que ocurren a un ritmo establecido”, explica la Dra. Stern. “Estas mutaciones no afectan al virus, es decir, se mantiene estable, pero pueden ayudarnos a rastrear la cadena de infección de un país a otro. Después de que estalló la pandemia en Wuhan, por ejemplo, ocurrieron una o dos mutaciones y un virus con una mutación puede haber migrado a Europa donde experimentó mutaciones adicionales, y desde allí viajó a los Estados Unidos, y así sucesivamente.

“Podemos ver estas mutaciones como una especie de código de barras que nos ayuda a realizar un seguimiento de la progresión y transformación del coronavirus a medida que se mueve de un país a otro”. Para obtener una imagen clara del origen de la infección en Israel, los investigadores compararon las secuencias genómicas de pacientes locales con unas 4.700 secuencias genómicas tomadas de pacientes de todo el mundo. Descubrieron que más del 70% de los pacientes habían sido infectados por una cepa de coronavirus que se originó en los EE. UU. El restante 30% de las infecciones fueron importadas de Europa y otros lugares: Bélgica (8%), Francia (6%), Inglaterra ( 5%), España (3%), Italia (2%), Filipinas (2%), Australia (2%) y Rusia
(2%).

Según la Dra. Stern, el nuevo mapa genómico proporciona información sobre la propagación precisa del nuevo coronavirus dentro de Israel. Hasta ahora, cualquier evaluación de la propagación de la infección se basaba en parámetros subjetivos como la retroalimentación del paciente. La nueva investigación podrá exponer la tasa de infección en un hogar, en un edificio de apartamentos, en una escuela, en un vecindario y más. También proporcionará detección temprana de súper esparcidores, personas que viajan por todas partes e infectan a un gran número de personas, e incluso podría identificar eventos importantes con el potencial de desencadenar una infección generalizada.

La importancia del 10%
“En el futuro, los datos obtenidos de la secuenciación genómica servirán como una base importante para tomar decisiones informadas sobre qué instituciones cerrarán, durante cuánto tiempo y en qué formato”, dice la Dra. Stern. Con los responsables políticos en mente, los investigadores desarrollaron un modelo estadístico complejo basado en la secuenciación genómica que estima los parámetros epidemiológicos de la propagación viral.

El modelo muestra que la tasa de infección disminuyó significativamente después de las estrictas medidas de cuarentena tomadas en Israel y destaca una gran discrepancia entre el número de personas infectadas por cada paciente con coronavirus. El modelo también estima que más del 80% de los casos de coronavirus en Israel fueron el resultado directo de solo el 10% de los pacientes con coronavirus en Israel, lo que significa que este 10% eran, de hecho, súper propagadores. Según el modelo y la secuencia genómica, la Dra. Stern dice que no más del 1% de la población en Israel contrajo el virus, muy lejos de la inmunidad colectiva.

“En nuestro estudio, realizamos la primera secuenciación genómica masiva del coronavirus en Israel”, concluye. “Esta tecnología y la información que proporciona es de gran importancia para comprender el virus y su propagación en la población, como una base científica y objetiva para la toma de decisiones locales y nacionales. Los datos obtenidos de la investigación pueden ayudar enormemente a los encargados de formular políticas en temas como como cierres y cuarentenas. Al hacerlo, el estudio hace una contribución significativa para hacer frente a la epidemia en Israel y, lo que es más importante: hemos desarrollado herramientas que nos permitirán hacer frente, en tiempo real, al próximo brote que pueda ocurrir”.

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